真空冷冻干燥机的工艺主要分为两阶段，一是冷冻阶段，一是真空阶段（也叫干燥或者升华阶段）。很多人在使用冻干机的过程中认为冷冻温度和干燥阶段的真空越低越好，其实不然。

每种物料的特性不一样，所以各自的结晶点业有所不同，冻干机的冷冻阶段的冷冻温度和捕水温度主要根据物料自身特点来决定的，并非是越低越好，温度过低浪费能耗，其次延长了物料在冷冻干燥机中时间。

干燥阶段又可分为预干燥、一次干燥和二次干燥。各个阶段的应用和所能达到的干燥程度主要取决于干燥工艺。

冷冻干燥机的预干燥是指主要去除自由湿气的*阶段干燥；

冷冻干燥机一次干燥是指主要去除自由湿气的干燥阶段，一次干燥只能在真空中进行；

冷冻干燥机二次干燥是指从冷冻干燥开始一直到*去除在固体聚合态中所含湿气的干燥阶段。